În anul 2029, secțiunea 9, un grup de polițiști îmbunătățiți din punct de vedere cibernetic, sunt chemați să investigheze și să oprească un hacker foarte căutat cunoscut sub numele de „Puppetmaster”. Ghost in the Shell 2.0 este o versiune reprodusă a omologului său original din 1995. Printre numeroasele îmbunătățiri, pentru lansarea 2.0 a filmului, s-au revizuit o serie de scene cu animație 3D, îmbunătățiri vizuale și coloana sonoră înregistrată în sunetul surround 6.1.