Expediția Atlantidei găsește misterios pe Daedalus, abandonat și în derivă în spațiu. Când echipa Lt. colonelului John Sheppard vine să cerceteze, nava dispare misterios. Descoperă curând că nava este de fapt un Daedalus alternativ dintr-o realitate alternativă, iar echipa trebuie să găsească o cale de a se întoarce către Universul lor sau să riscă să fie blocată pentru totdeauna într-o realitate necunoscută.